本刊于1979年9月创刊，到2001年9月已出版89期。接受国内外的有关海洋、湖沼科学领域的首发论文及述评。尤其重视在生产实践和科研第一线青年作者的成果。本刊试图打破传统的权威束缚，不囿于某种学术观点，凡有一得之见的成果，甚至还会到起到的文章，特别重视、审稿严而且又不为成风所感，要由不同观点的审者参与审稿。
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开设栏目：
海洋物理、水文气象、化学地质、生物水产、湖海河流、论文及研究报告
《海洋湖沼通报》稿约
海洋湖沼通报_评估说明
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